一、行政后勤科室

1.院长办公室（档案管理中心）

2.党委办公室

3.宣传科

4.工会

5.纪检监察室

6.团委

7.人力资源部（离退休管理服务办公室、人才引进办公室）

8.财务部（财务科、经管科、医保科）

9.质控科（病案室、统计室）

10.医务部（医患协调办公室、互联网医院办公室）

11.护理部                

12.教学部

13.科研部

14.控制院内感染办公室

15.审计科

16.招标办公室

17.信息科

18.基建科

19.医工科

20.对外联络办公室

21.保卫科（南院区）

22.后勤保障部（南院区、北院区）

23.西安市骨科研究所办公室

24.重点实验室建设办公室

二、临床科室

（一）五个院中院

1.脊柱病医院（椎间盘与畸形病区、颈椎病区、腰椎病区、退变与肿瘤病区、创伤与老年脊柱病区、侧弯与疼痛病区、微创一病区、微创二病区）

2.关节病医院（髋关节病区、膝关节病区、骨坏死与关节重建病区、风湿免疫关节矫形病区、关节翻修病区、综合病区）

3.骨创伤医院（上肢病区、下肢病区、环骨盆病区、老年骨科病区、严重多发创伤病区、综合病区）

4.康复医院（疼痛病区、神经脊柱病区、骨关节病区、创伤康复病区、中医康复科）

5.儿童病医院（矫形重建病区、损伤修复病区、综合病区、小儿科、计划免疫门诊）

（二）八个诊疗中心

1.手外科诊疗中心（南院区、北院区）

2.运动医学诊疗中心（上肢病区、下肢病区、综合病区）

3.足踝外科诊疗中心（微创与矫形病区、创伤与退变病区、综合病区）

4.中西医结合骨科诊疗中心（中西医结合骨科、股骨头坏死病区、手法复位室）

5.骨与软组织修复重建诊疗中心（骨显微修复外科、烧伤科、周围血管科、皮肤科）

6.消化疾病诊疗中心（消化内科、消化外科）

7.代谢疾病诊疗中心（骨质疏松科、风湿免疫内分泌科）

8.麻醉急危重症诊疗中心（急诊医学科、南院区重症医学科、北院区重症医学科、南院区手术麻醉部、北院区手术麻醉部）

（三）设病床科室

1.骨病肿瘤科

2.呼吸内科

3.全科医学科

4.血液肿瘤放疗科

5.心血管内科（南院区、北院区）

6.神经内科

7.肾脏内科

8.感染科

9.神经外科

10.胸外科

11.泌尿外科

12.耳鼻咽喉头颈与整形美容外科

13.眼科

14.口腔科                            

15.妇产科

16.日间手术中心

17.心身医学科

18.高压氧科

19.营养膳食科

三、医技及医辅科室

1.医学影像中心（放射科、术中影像科、CT室、磁共振室、南院区超声医学科、北院区超声医学科）

2.核医学科

3.功能检查科

4.检验科

5.输血科

6.病理科

7.药学部（药剂科、临床药学科、药物临床试验办公室）

8.消毒供应中心

9.转化医学中心

10.大数据管理中心

11.患者服务中心

12.门诊办公室

13.保健科

四、科研教学学术机构

1.陕西省骨科医院

2.西安交通大学附属红会医院

3.西安医学院附属红会医院

4.陕西中医药大学教学医院

5.延安大学研究生联合培养基地

6.西安市骨科研究所

7.博士后科研工作站

8.西安市博士后创新基地

9.美中国际创伤杂志编辑部

10.陕西省骨科医疗集团总院

11.国家住院医师规范化培训基地

12.国家骨科与运动康复临床研究中心分中心

13.陕西省脊柱脊髓疾病临床医学研究中心

14.陕西省脊柱仿生治疗重点实验室

15.陕西省运动与康复临床医学研究中心

16.陕西省儿童骨骼畸形与损伤疾病临床医学研究中心

17.西安市骨骼发育畸形与损伤修复重点实验室

18.西安骨质疏松与脊髓损伤治疗及研究国际科技合作基地